A RNED tem por missão promover a melhoria constante da qualidade dos Programas de Doutoramento (PD), cujos objectivos gerais e estratégicos integram:
a) Intercâmbio de experiências académicas e organizativas, no âmbito das Escolas Doutorais (nacionais e europeias);
b) Definição de padrões de funcionamento do ensino nos PD – padrões de qualidade e boas práticas: PD com currículos integrados, interdisciplinares, inovadores, coordenados e conjuntos e em associação;
c) Harmonização de normas e modelos comuns, nos termos da legislação em vigor, nomeadamente em relação a: organização de provas de doutoramento; título de Doutoramento Europeu; regime de co-tutela e outros;
d) Captação de financiamentos competitivos nacionais e internacionais, com a realização de candidaturas conjuntas a programas e projetos;
e) Criação de redes e programas doutorais conjuntos e em associação;
f) Fomento da internacionalização: estabelecer cooperação com outras instituições internacionais com a mesma natureza e finalidade;
g) Dinamização da cooperação ensino e unidades I&D associadas a IES que assinam o presente acordo, apostando numa cultura científica de excelência – integração da atividade científica doutoral em unidades I&D;
h) Dinamização e potenciação do intercâmbio académico interinstitucional, fomentando assim a qualidade dos PD: frequência de unidades curriculares, acreditação e diplomas conjuntos, mediante o cumprimento dos critérios legalmente exigidos;
i) Implementação de um plano de formação transversal “soft skills” integrado e inovador, destinado aos estudantes de doutoramento das instituições de ensino superior (IES) que assinam o presente acordo.
j) Promoção de outras atividades de cooperação – intercâmbio de docentes, não docentes e estudantes, organização de eventos conjuntos (seminários, conferencias, ou outros eventos);
k) Reforço da posição das IES, na formulação das políticas nacionais de educação e ciência, junto de entidades como a DGES, A3ES e FCT.